（A）專書

• 2013 靳菱菱，《認同的路徑：撒奇萊雅族與太魯閣族的比較研究》，高雄市：麗文文化出版社。
• 2020 靳菱菱，《增修臺東縣史—自治篇》，臺東縣政府。
• 2022 靳菱菱，《卑南鄉誌—政事篇》，卑南鄉公所。

（B）期刊論文（精選）

• 2003 靳菱菱，〈公共利益?誰的利益:利益團體相關理論探討〉，《台東師院學報》，第十四期(上)，頁 327-346。
• 2004 靳菱菱，〈政黨版圖與地方政治：台東縣選民投票行為初探〉，《東台灣研究》，第九期，頁 107-141。
• 2005 靳菱菱，〈文化與政治：一個布農部落選舉行為的觀察〉，《東台灣叢刊之七》，頁 57-76。
• 2006 靳菱菱，〈文化論述中的權力：從布農文教基金會的文化復振看布農族的權力觀〉，《台灣人類學刊》，第四卷第二期，頁 113-149。（TSSCI）
• 2007 靳菱菱、羅鳳娟，〈國家施為與地方不發展：以台東縣為例〉，《研究文化月報》，第七十五期。
• 2009 靳菱菱，〈從民主理論反思台灣少數民族的政治參與：淺析台東布農族政治文化的現代適應〉，《崑山科技大學人文暨社會科學學報》，第一卷第一期，頁 31-60。
• 2010 靳菱菱，〈族群認同的建構與挑戰：台灣原住民族正名運動的省思〉，《思與言》，第四十八卷第二期，頁 119-157。
• 2010 靳菱菱，〈文化的發現與發明：撒奇萊雅族群建構的歷程與難題〉，《台灣人類學刊》，第八卷第三期，頁 119-161。（TSSCI）
• 2010 靳菱菱，〈漁場保育與族群文化發展的兩難:以台東富山漁場及蘭嶼禁漁區為例〉，《社會與區域發展學報》，第三卷第一期，頁 1-25。
• 2012 包正豪、靳菱菱，〈「後山意識」與公民政治參與：花東區域研究初探〉，《社會與區域發展學報》，第三卷第二期，頁 31-66。
• 2012 靳菱菱，〈反核或擁核？核廢料儲置場之審議式民主討論與原住民部落發展〉，《台灣原住民研究季刊》，第五卷第二期（夏季號），頁 1-39。
• 2012 靳菱菱，〈西方宗教與台灣原住民族群認同建構的幾點觀察〉，《國科會人文與社會科學簡訊》，第十三卷第三期，頁 97-105。
• 2013 靳菱菱，〈傳統領域？誰來界定？兼論原住民族基本法及相關立法的局限〉，《臺灣環境與土地法學雜誌》，第一卷第六期，頁 179-202。
• 2022 郭信宏、靳菱菱（通訊作者），〈地方創生在部落：以都蘭部落為例〉，《台灣原住民研究》，第15卷第1期，頁 43-90。

（C）研討會論文（精選）

• 1998 靳菱菱，〈我國選舉制度對地方政治精英錄用的制約：以 1993-1995 為例〉，東海大學：地方議會：回顧與展望學術研討會。
• 2001 靳菱菱，〈儒家思想與民主轉型：以台灣地方精英民主認知為例〉，亞洲儒家文化社會文化學術研討會。
• 2003 靳菱菱，〈文化與政治：一個原住民部落選舉行為的觀察〉，台東大學：邊陲社會及其主體性學術研討會。
• 2006 靳菱菱，〈民主鞏固與公民意識的裂解：以台東布農族政治文化流變為例〉，政治大學：中國政治學會年會暨學術研討會。
• 2008 靳菱菱，〈族群認同的建構與挑戰：台灣原住民族正名運動的政治學觀點〉，中正大學：中國政治學年會暨學術研討會。
• 2010 靳菱菱，〈選舉政治與文化轉型:兩個原住民部落的比較研究〉，中山大學：中國政治學會年會暨學術研討會。
• 2013 靳菱菱，〈基督宗教與社會運動：以太魯閣族正名運動為例〉，中山大學：台灣政治學會年會暨學術研討會。

（D）研究計畫（精選）

• 2004.08-2006.07 國科會「傳統的失落與再造：台東布農族政治文化研究（I, II）」
• 2006.08-2008.07 國科會「國家施為與文化再構：台東布農族聚落的比較研究」
• 2008.08-2011.07 國科會「西方宗教與族群意識的形塑：三個台灣原住民族的比較研究（I, II, III）」
• 2011.08-2014.07 國科會「認同的路徑：撒奇萊雅族與太魯閣族的比較研究」
• 2019.07-2022.06 科技部「局內的Djalan(路)與局外的Tjekeza(橋)：南迴區域主體性的共構與創生」
• 2022.08-2023.07 國科會「流（sisekautjan）與勢（sivaikan）：共創南迴永續的條件」
• 2023.01-2024.12 教育部「從我到我們：大學與社區跨域共做共好社會實踐計畫」
• 2024.02-2026.01 教育部「臺東慢·漫拾露學計畫」

（A）期刊論文

• 2005 李玉芬、高淑娟，〈台東市馬蘭社阿美族的傳統集會所與部落社會的中心性〉，《東台灣研究》，10，頁 65-110。
• 2006 李玉芬，〈馬蘭社阿美族集會所的區位、功能與台東平原社會環境的變遷〉，《台大地理學報》，45，頁 73-94。（TSSCI）
• 2009 李玉芬，〈燒風大，拜天公，卑南高台有關焚風的祭拜活動〉，《東台灣研究》，13，頁 135-148。
• 2009 李玉芬、林炯明、沈淑敏，〈台東焚風的時空特性及其影響〉，《台灣文獻》，60 卷 4 期，頁 213-252。
• 2010 李玉芬、李鑫豪、黃颸雅，〈那一個中秋夜，大火焚毀大南村─1969年台東達魯瑪克部落焚風記事〉，《東台灣研究》，15，頁 93-120。
• 2011 李玉芬、江偉全，〈綠島漁民的漁撈生活調查〉，《東台灣研究》，17，頁 97-120。

（B）專書與專書論文

• 2005 李玉芬，〈消失中的都市部落？台東市馬蘭社阿美族生活空間的形成與轉變〉，夏黎明主編《邊陲社會及其主體性研討會論文集》。
• 2007 李玉芬，〈人口〉，《鹿野鄉志社會篇》，頁 1-41。
• 2007 李玉芬，《消失中的都市部落？台東市馬蘭社阿美族生活空間的形成與轉變》，高雄：麗文。
• 2008 李玉芬、田輝鴻，〈綠島的地名與居民的維生方式〉，《台灣地名研究成果學術研討會論文集》，頁 327-344。
• 2008 李玉芬，《綠島鄉誌增修訂計畫期末報告書》，台東縣綠島鄉公所。
• 2008 李玉芬、江偉全，《綠島漁業生物及漁撈活動調查期末報告書》，內政部營建署。
• 2009 李玉芬等，《尋覓新天地於山海之間─東海岸族群故事》，觀光局東管處。
• 2011 李玉芬、吳育臻，〈後堆〉，《六堆客家舊聚落調查報告書》，客家委員會。

（C）研討會論文

• 2005 李玉芬、高淑娟，〈台東市馬蘭社阿美族的傳統集會所與部落社會的中心性〉，《文化想像與中心再構：地方社會的發展策略與實踐學術研討會》。
• 2005 李玉芬，〈馬蘭社阿美族集會所的區位、功能與台東平原社會環境的變遷〉，《第九屆台灣地理國際學術研討會》。
• 2008 李玉芬、田輝鴻，〈綠島的地名與居民的維生方式〉，台灣地名研究成果學術研討會。
• 2009 李玉芬、林炯明、沈淑敏，〈台東焚風的時空特性及其影響〉，臺灣自然災害史與災後重建學術研討會。
• 2011 Lee Yu Fen, Hsia Li Ming, "Location and Small City Character: A Case Study of Taitung City, Taiwan", UGI 2011 Regional Geographic Conference, Santiago, Chile.

（D）研究計畫

• 2002.09-2006.08 教育部「轉型與創新~台東大學基礎課程之建構、實踐與評鑑社會科學院研究計劃」
• 2003.05-2006.04 鹿野鄉公所「台東縣鹿野鄉志編審委員；〈社會篇〉撰修」
• 2004.08-2005.07 國科會「國家作為與部落貧困化─馬蘭社阿美族社會與經濟變遷(Ⅱ)」
• 2005.01-2005.12 台東市公所「台東縣台東市阿美族史市誌篇編纂計畫纂修」
• 2006.08-2007.07 國科會「戰後台東糖廠的經營變遷與地方產業的發展」
• 2007.01-2007.12 內政部營建署「綠島漁業生物及漁撈活動調查」主持人
• 2007.05-2008.04 綠島鄉公所「綠島鄉誌增修訂計畫」主持人
• 2009.05-2009.12 觀光局東管處「東海岸歷史故事書籍製作計畫」主持人
• 2012.06.01-2012.12.31 台東縣政府文化處「台東地方文化生活圈社區活事計畫」
• 2012.07.01-2012.12.31 台東縣政府文化處「台東寶桑都市紋理紀錄計畫」

（A）代表性專書與畫集

• 著有《林永發水墨畫集》七冊、《醇味山海臺東情》、《自然與藝境》、《窮理盡性》、《日出‧台東‧丁學洙》、《台灣美術發展史全集－台東篇》、《藝海情深父子畫集》等。
• 2000 《你是我的兄弟》
• 2001 《東海岸之美林永發水墨畫集》
• 2003 《藝術行政與藝術專業的遇合》
• 2003 《臺灣美術地方發展史全集臺東地區》
• 2004 《都蘭山傳奇》（主編）
• 2005 《日月山海富麗臺東-蘭嶼寫生》
• 2006 《孺慕之歌畫集》（中文版及韓文版）
• 2007 《自然與意境─林永發水墨畫創作理念與作品解析》
• 2008 《臺灣水墨趨向》
• 2009 《日出‧臺東 丁學洙》
• 2010 《父子心靈對話》

（B）論文發表（精選）

• 2001 研討會論文 〈文化認同與藝術創作〉
• 2002 研討會論文 〈臺灣原住民聚落之圖書館發展現況〉
• 2003 期刊論文 〈從藝術與人文領域看全人教育在科技整合教育的角色〉
• 2003 期刊論文 〈坐落在山海間的圖書館行銷策略以臺東縣政府文化局圖書館為例〉
• 2007 期刊論文 〈從書法活動啟發特殊兒童無限潛能-唐氏兒個案探討〉
• 2009 期刊論文 〈不知從，安知去?從臺灣美術史看七友畫會〉
• 2010 研討會論文 〈從生活美學關心下一代〉

（A）專書

• 2010 陳錦忠，《雕塑符號與傳達》，台北：秀威資訊。

（B）論文

• 2004 陳錦忠，〈西班牙小學藝術教育的理論基礎〉，第一屆台東大學人文藝術研討會。
• 2007 陳錦忠，〈由感知方式探討雕塑的閱讀〉，《國立嘉義大學人文藝術學院藝術研究期刊》，第二期。
• 2008 陳錦忠，〈影像中圖像與造形符號的關係〉，《國立台灣藝術大學藝術學報》，第83期。

• 2012 《協奏曲之夜》— 國立臺東大學交響樂團演奏會
• 2012 《迴異鄉頌‧你來傳承》— 郭子究紀念音樂會
• 2011 原住民歌劇《逐鹿傳說》— 國立臺東大學交響樂團暨合唱團，臺北國家戲劇院演出
• 2010 原住民交響詩《蘭嶼之歌》— 臺東大學交響樂團巡迴演奏會（臺北國家音樂廳等）
• 2009 《臺東大學樂壇新秀音樂會》— 巡迴演奏會
• 2008 原住民交響詩《祭儀》（Lu'san）— 巡迴演奏會（臺北國家音樂廳等）
• 2008 唐尼采第歌劇《愛情靈藥》— 臺東縣政府文化暨觀光處藝文中心
• 2007 貝多芬自由的禮讚《快樂頌》— 嘉義大學與臺東大學交響樂團暨合唱團聯合演奏會
• 2006 雷昂卡洛瓦歌劇《丑角》— 國立臺東大學交響樂團演出
• 2006 韓德爾神劇《彌賽亞》— 國立臺東大學交響樂團暨合唱團演出

（A）主要專書與專書論文（精選）

• 1974 《馮延巳研究》，嘉新水泥公司文化基金會。
• 1986 《試論兒童詩教育》，臺灣省政府教育廳。
• 1987 《兒童文學故事體寫作論》，高雄：復文書局。
• 1988 《兒童詩歌研究》，高雄：復文書局。
• 1989 《朗誦研究》，台北：文史哲出版社。
• 1989 《兒童文學論述選集》（主編），台北：幼獅文化。
• 1989 《兒語三百則與理論研究》（編著），台北：知音出版社。
• 1993 《兒童文學》（召集），台北：國立空中大學。
• 1994 《楊喚與兒童文學》，台東：東師語教系。
• 1995 《歷代啟蒙教材初探》，台東：東師語教系。
• 1996 《兒童文學》（合著），台北：五南圖書。
• 1999 《台灣區域兒童文學概要》（主編），國立臺東師範學院兒童文學研究所。
• 2000 《彩繪兒童又十年——臺灣1945~1998兒童文學書目》，台北：幼獅文化。
• 2000 《試論我國近代童話觀念的演變——兼論豐子愷的童話》，台北：萬卷樓。
• 2001 《臺灣文學》（主編），台北：萬卷樓。
• 2003 《兒童讀物編輯小組的歷史與身影》（合著），國立臺東大學兒童文學研究所。

（B）期刊論文（精選）

• 1973 ＜段氏六書音均表＞，《台東師專學報》，第一期。
• 1975 ＜兒童文學製作之理論＞，《台東師專學報》，第三期。
• 1981 ＜兒童詩歌研究＞，《台東師專學報》，第九期。
• 1983 ＜歷代啟蒙教材初探＞，《台東師專學報》，第十一期。
• 1989 ＜楊喚研究＞，《台東師院學報》，第二期。
• 1991 ＜釋童謠＞，《東師語文學刊》，第四期。
• 1992 ＜謎語研究＞，《臺東師院學報》，第四期。
• 1993 ＜試論台灣童謠＞，《臺東師院學報》，第五期。
• 1998 ＜釋童話＞，《兒童文學學刊》，創刊號。
• 2000 ＜敘述、敘事與故事＞，《兒童文學學刊》，第3期。
• 2001 ＜臺灣兒童文學的建構與分期＞，《兒童文學學刊》，第5期。
• 2003 ＜性別平等與兒童文學＞，《兒童文學學刊》，第9期。
• 2004 ＜台灣兒童文學研究「外來論述」的現象考察＞，《兒童文學學刊》，第十一期。
• 2004 ＜台灣兒童閱讀的歷程＞，《兒童文學學刊》，第十二期。
• 2005 ＜兩岸兒童文學文體比較研究＞，《兒童文學學刊》，第十四期。
• 2006 ＜敘說兒童文學教師作家團隊＞，《兒童文學學刊》，第十五期。

（C）代表性研究專案

• 1996-1998 國科會「海峽兩岸兒童文學交流之研究（I, II）」
• 1998-2001 國科會「台灣地區兒童文學史料的整理與撰寫（1/3~3/3）」
• 2000-2003 文建會「兒歌徵選活動」
• 2001-2004 國科會「台灣兒童文學發展史中指標事件之整理與撰寫（I, II, III）」
• 2004-2006 國科會「台灣圖畫作家訪問與台灣圖畫書發展研究（I, II）」
• 2005-2007 臺灣文學館「臺灣兒童文學作家重要作品目錄編輯計畫（1901-2005）」